Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja1P23242 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja1P23242 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gja1P23242 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja1P23242 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms