Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PparaP23204 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PparaP23204 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PparaP23204 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PparaP23204 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PparaP23204 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PparaP23204 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PparaP23204 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PparaP23204 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PparaP23204 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PparaP23204 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PparaP23204 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PparaP23204 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PparaP23204 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PparaP23204 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PparaP23204 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PparaP23204 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PparaP23204 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PparaP23204 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PparaP23204 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PparaP23204 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PparaP23204 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PparaP23204 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PparaP23204 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PparaP23204 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PparaP23204 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PparaP23204 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PparaP23204 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PparaP23204 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PparaP23204 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PparaP23204 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PparaP23204 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PparaP23204 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PparaP23204 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PparaP23204 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PparaP23204 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PparaP23204 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PparaP23204 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PparaP23204 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PparaP23204 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PparaP23204 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PparaP23204 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PparaP23204 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PparaP23204 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PparaP23204 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PparaP23204 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PparaP23204 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PparaP23204 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PparaP23204 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PparaP23204 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PparaP23204 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PparaP23204 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PparaP23204 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PparaP23204 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PparaP23204 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PparaP23204 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PparaP23204 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PparaP23204 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PparaP23204 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PparaP23204 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PparaP23204 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PparaP23204 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PparaP23204 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PparaP23204 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PparaP23204 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PparaP23204 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PparaP23204 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PparaP23204 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PparaP23204 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PparaP23204 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PparaP23204 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PparaP23204 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PparaP23204 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PparaP23204 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PparaP23204 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PparaP23204 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PparaP23204 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PparaP23204 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms