Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR2CP19387 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms