Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms