Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rag1P15919 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rag1P15919 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rag1P15919 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rag1P15919 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rag1P15919 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rag1P15919 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms