Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim30aP15533 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim30aP15533 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim30aP15533 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim30aP15533 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim30aP15533 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim30aP15533 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim30aP15533 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim30aP15533 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim30aP15533 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim30aP15533 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim30aP15533 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim30aP15533 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim30aP15533 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim30aP15533 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim30aP15533 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim30aP15533 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim30aP15533 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim30aP15533 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trim30aP15533 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms