Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb5P09079 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb5P09079 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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