Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lancl1O89112 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lancl1O89112 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms