Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Casp8O89110 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Casp8O89110 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Casp8O89110 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casp8O89110 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casp8O89110 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp8O89110 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp8O89110 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casp8O89110 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casp8O89110 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms