Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd7O88665 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd7O88665 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd7O88665 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms