Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sap30O88574 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sap30O88574 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sap30O88574 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sap30O88574 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms