Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dsg2O55111 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms