Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptpn20O55082 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn20O55082 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms