Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc3O55013 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc3O55013 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms