Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FxnO35943 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FxnO35943 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FxnO35943 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FxnO35943 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FxnO35943 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FxnO35943 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FxnO35943 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FxnO35943 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FxnO35943 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FxnO35943 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FxnO35943 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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FxnO35943 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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FxnO35943 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FxnO35943 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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FxnO35943 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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FxnO35943 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FxnO35943 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FxnO35943 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FxnO35943 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FxnO35943 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FxnO35943 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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FxnO35943 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FxnO35943 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FxnO35943 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FxnO35943 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FxnO35943 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FxnO35943 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FxnO35943 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FxnO35943 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FxnO35943 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FxnO35943 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FxnO35943 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FxnO35943 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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FxnO35943 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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FxnO35943 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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FxnO35943 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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FxnO35943 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FxnO35943 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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FxnO35943 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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FxnO35943 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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FxnO35943 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FxnO35943 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FxnO35943 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FxnO35943 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FxnO35943 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FxnO35943 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FxnO35943 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FxnO35943 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FxnO35943 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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FxnO35943 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FxnO35943 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FxnO35943 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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FxnO35943 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms