Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp100O35892 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp100O35892 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp100O35892 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp100O35892 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp100O35892 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp100O35892 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp100O35892 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp100O35892 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sp100O35892 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp100O35892 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sp100O35892 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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