Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfibp2O35711 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms