Protein–RNA interactions for Protein: O35701

Matn3, Matrilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn3O35701 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Matn3O35701 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Matn3O35701 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Matn3O35701 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms