Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms