Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf5O35445 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rnf5O35445 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rnf5O35445 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rnf5O35445 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rnf5O35445 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rnf5O35445 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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