Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gfra3O35118 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms