Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casq1O09165 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casq1O09165 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casq1O09165 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casq1O09165 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casq1O09165 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Casq1O09165 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Casq1O09165 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casq1O09165 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casq1O09165 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casq1O09165 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casq1O09165 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Casq1O09165 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms