Protein–RNA interactions for Protein: J3QN84

Gm21812, Predicted gene, 21812, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21812J3QN84 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21812J3QN84 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms