Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21818J3KMS6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm21818J3KMS6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms