Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ94

Pira2, Paired-Ig-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pira2F8VQ94 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pira2F8VQ94 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pira2F8VQ94 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pira2F8VQ94 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pira2F8VQ94 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pira2F8VQ94 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pira2F8VQ94 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pira2F8VQ94 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pira2F8VQ94 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pira2F8VQ94 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pira2F8VQ94 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pira2F8VQ94 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pira2F8VQ94 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pira2F8VQ94 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pira2F8VQ94 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pira2F8VQ94 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pira2F8VQ94 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pira2F8VQ94 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pira2F8VQ94 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pira2F8VQ94 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pira2F8VQ94 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pira2F8VQ94 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms