Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm8247F6VRJ8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm8247F6VRJ8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm8247F6VRJ8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm8247F6VRJ8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm8247F6VRJ8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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