Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28374F6SG70 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28374F6SG70 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28374F6SG70 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28374F6SG70 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28374F6SG70 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28374F6SG70 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28374F6SG70 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28374F6SG70 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28374F6SG70 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28374F6SG70 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28374F6SG70 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28374F6SG70 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28374F6SG70 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28374F6SG70 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28374F6SG70 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28374F6SG70 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28374F6SG70 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms