Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms