Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmod3E9QA62 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms