Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L2

Pi4ka, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4kaE9Q3L2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pi4kaE9Q3L2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pi4kaE9Q3L2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms