Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm3095E9Q058 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm3095E9Q058 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms