Protein–RNA interactions for Protein: E0CYQ0

Kctd17, MCG13350, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd17E0CYQ0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kctd17E0CYQ0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kctd17E0CYQ0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms