Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rdh8D3Z6W3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rdh8D3Z6W3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms