Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms