Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brpf3B2KF05 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brpf3B2KF05 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms