Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3173A6NAS3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3173A6NAS3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.9 ms