Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms