Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H2al1jA2BFR3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H2al1jA2BFR3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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