Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rtf1A2AQ19 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rtf1A2AQ19 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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