Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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