Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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Hoxd9P28357 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Hoxd9P28357 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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Hoxd9P28357 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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Hoxd9P28357 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Nsun6-203ENSMUST00000114713 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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