Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubash3bQ8BGG7 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms