Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rpusd2Q149F1 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms