Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtpreP49446 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PtpreP49446 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
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