Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Hoxd9P28357 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.6 ms