Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Dsg1bQ7TSF1 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms