Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm17190V9GX38 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17190V9GX38 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms