Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Upk1bQ9Z2C6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Upk1bQ9Z2C6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms