Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ap3b1Q9Z1T1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ap3b1Q9Z1T1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.4 ms