Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf394Q9Z1D9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf394Q9Z1D9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf394Q9Z1D9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Znf394Q9Z1D9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Znf394Q9Z1D9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms